Presidenten velges ved absolutt flertall for en 5–års periode.
Underhuset, Wolesi Jirga, med 249 medlemmer, velges ved forholdstallsvalg for 5-årige perioder. Det skal etter planen avholdes nye parlamentsvalg 18. september 2010.
I overhuset (Meshrano Jirga), velges 34 medlemmer fra regionene for 4 år, 34 medlemmer velges ved regionale valg for en 3 – årig periode, mens 34 medlemmer utnevnes av presidenten for 5 år.
I 2004 ble Afghanistans første demokratiske presidentvalg gjennomført. Blant 18 kandidater vant Hamid Karzai med over 55 prosent av stemmene. I årsskiftet 2004 – 2005 ble det avholdt en Loja Jirga (et afghansk storråd) som fastsatte en ny grunnlov. Parlaments – og provinsrådsvalg ble avholdt for første gang på over 30 år i 2005.
20. august 2009 ble det for annen gang avholdt presidentvalg og provinsrådsvalg, denne gangen under afghansk lederskap, med støtte fra det internasjonale samfunnet og FNs valgorgan i Afghanistan. Det ble avdekket omfattende valgjuks som førte til at det endelige valgresultatet ble flere måneder forsinket. Det er presidenten som peker ut forslag til kandidater i regjeringen, og disse må godkjennes av parlamentet.
Det er den uavhengige valgkommisjonen (IEC - Independent Electoral Commission) som har hovedansvaret for gjennomføringen av valg i Afghanistan. FNs valgorgan UNDP ELECT har bistått med finansiell og teknisk støtte under de foregående valgene. Det er også opprettet en klagekommisjon (ECC - Electoral Complaints Commission) som har til oppgave å behandle anklager om valgfusk.
Parlamentsvalgene 2010
Årets parlamentsvalg skulle i henhold til grunnloven avholdes 22. mai, men ble på grunn av den vanskelige sikkerhetssituasjonen og behovet for valgreformer utsatt til 18. september. Årets parlamentsvalg er også de første parlamentsvalgene afghanske myndigheter har ansvar for.
Gjennomføringen av presidentvalgene 2009 avdekket omfattende valgjuks. For å unngå et like stort omfang juks under parlamentsvalgene, mener FN og det internasjonale samfunnet at et minimum av reformer må gjennomføres. Det er spesielt behov for rettslig forfølgelse av valgoffiserer som stod bak valgjukset under presidentvalget, samt endring i strukturene av valgkommisjonen og klagekommisjonen. Dette er de to kommisjonene som har hovedansvaret for at valgene går riktig for seg. Videre stilles det fra internasjonal side sterkere krav til oversiktlige opptellingsprosesser og kontroll med de enkelte valgstasjoner for å hindre valgjuks.
Under fjorårets presidentvalg bidro det internasjonale samfunnet til valgene gjennom FNs valgprogram i Afghanistan, UNDP ELECT. Det er fremdeles behov for internasjonal støtte til valgene, og mye av denne vil sannsynligvis gå gjennom FN.
Norge har støttet valgene i Afghanistan gjennom UNDP ELECT i perioden 2008 – 2010 med til sammen over 70 millioner kroner. Valg er en viktig del av demokratiseringsprosessen og arbeidet med styrking av demokratiske institusjoner. Samtidig er gjennomføring av åpne og demokratiske valg en stor utfordring når konflikt fremdeles gjør store deler av landet utrygt. Det er derfor viktig å ha et langsiktig perspektiv i arbeidet med valgprosesser i Afghanistan.